Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TspoP50637 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TspoP50637 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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