Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms