Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SftpdP50404 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SftpdP50404 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SftpdP50404 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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SftpdP50404 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SftpdP50404 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SftpdP50404 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpdP50404 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SftpdP50404 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SftpdP50404 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpdP50404 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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