Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hoxc13P50207 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hoxc13P50207 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hoxc13P50207 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Hoxc13P50207 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxc13P50207 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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