Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmod1P49813 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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