Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms