Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpl28P41105 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
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