Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VhlP40338 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms