Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rom1P32958 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms