Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms