Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NapbP28663 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NapbP28663 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms