Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
U2af2P26369 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
U2af2P26369 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms