Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PparaP23204 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PparaP23204 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PparaP23204 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PparaP23204 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PparaP23204 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PparaP23204 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PparaP23204 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PparaP23204 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PparaP23204 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PparaP23204 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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