Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a2P20490 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms