Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ntf3P20181 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms