Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18530 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18530 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18530 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms