Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18525 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18525 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18525 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18525 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18525 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18525 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18525 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18525 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18525 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18525 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18525 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms