Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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