Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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