Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms