Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1bP0C7A0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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