Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms