Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04212 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04212 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04212 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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