Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01787 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01787 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01787 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01787 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P01787 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01787 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01787 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01787 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms