Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BlmO88700 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BlmO88700 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BlmO88700 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BlmO88700 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BlmO88700 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BlmO88700 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BlmO88700 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BlmO88700 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BlmO88700 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms