Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sap30O88574 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sap30O88574 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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