Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cops6O88545 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cops6O88545 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cops6O88545 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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