Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Foxq1O70220 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms