Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms