Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DffaO54786 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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DffaO54786 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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DffaO54786 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DffaO54786 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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