Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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