Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FxnO35943 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FxnO35943 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FxnO35943 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms