Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrt1O35449 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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