Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Cnih1O35372 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Cnih1O35372 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih1O35372 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Cnih1O35372 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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