Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms