Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MttpO08601 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MttpO08601 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MttpO08601 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MttpO08601 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms