Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3278L7N2D2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms