Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20939L7N243 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms