Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms