Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm20795J3QP49 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm20795J3QP49 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm20795J3QP49 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm20795J3QP49 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm20795J3QP49 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm20795J3QP49 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm20795J3QP49 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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