Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6594J3QM43 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms