Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmgcF6VRN1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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