Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8247F6VRJ8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8247F6VRJ8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8247F6VRJ8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm8247F6VRJ8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8247F6VRJ8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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