Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms