Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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