Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms