Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf3B2RQG2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms