Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Trabd2bB1ATG9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Trabd2bB1ATG9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Trabd2bB1ATG9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Trabd2bB1ATG9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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