Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp36B1AQJ2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp36B1AQJ2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp36B1AQJ2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp36B1AQJ2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp36B1AQJ2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms