Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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